Criblage à haut débit
L’activité de criblage à haut débit (High Throughput Screening, HTS) est essentielle au processus de découverte de nouveaux médicaments. Il consiste à sélectionner parmi des milliers de molécules celles qui pourraient avoir un usage pharmaceutique. Pour ce faire, de grandes bibliothèques de composés repositionnables sont testées sur un modèle biologique présentant une cible thérapeutique spécifique.
Forte de plus de 15 ans d’expertise dans le criblage de modèle biologique pertinents de maladies rares et ultra rares (cellules immortalisées et dérivés d’hIPS), la plateforme évalue la faisabilité, conseille et oriente les équipes de recherche dans le développement de leurs projets, de la miniaturisation de l’essais cellulaire en microplaque (96-384) jusqu’au choix d’un biomarqueur quantifiable à haut débit.
Lorsque le test cellulaire est suffisamment robuste, elle réalise la campagne de criblage primaire à une ou plusieurs doses en mono/quadruplicats, les retests et l’évaluation des EC/IC50 sur des librairies de molécules repositionnables personnalisées.
| METHODES DE QUANTIFICATIONS DE BIOMARQUEURS DISPONIBLES
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| HCS |
Quantification de proteines membranaires |
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Quantification de proteines nucléaires |
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Translocation de proteines |
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Colocalisation de proteines |
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| HTS |
Tests biochimiques variés (fluorescence ; luminescence) |
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Quantification de proteines (Alpha Screen ; Alpha LISA ; HTFR) |
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Quantification de test luciferase (Surexpression…) |
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Quantification de marqueurs en absorbance |
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HCS : High Content Screening
En complément de cette activité, la plateforme mène des programmes de R&D permettant le développement de nouveaux essais biochimiques et moléculaires mais aussi de nouveaux outils cellulaires facilitant la quantification de biomarqueurs spécifiques.
Équipe
Johana Tournois
Resp. de plateforme (CECS)
Johana a rejoint I-Stem en 2006 et est responsable de la plateforme de criblage depuis 2016. Elle est spécialisée en robotique, data management et miniaturisation.
Amandine Thibaudeau
Ingénieure Plateforme (CECS)
Amandine a rejoint la plateforme fin 2022 afin de renforcer l’équipe de Criblage. Amandine a un Master Genie Cellulaire à L’université de Poitiers.
Yanis Genevois
Apprenti Technicien plateforme (CECS)
Yanis est arrivé en octobre 2023 au sein d’I-Stem en tant qu’alternant dans l’équipe de criblage à haut débit. Après un DUT génie biologique, il est actuellement en troisième année de BUT génie biologique parcours biologie médicale et biotechnologie.
Justine Rousselot
Technicienne Plateforme (CECS)
Après un DUT Génie Biologique et une première spécialisation en robotique et NGS, Justine a rejoint I-Stem en février 2024, en tant que technicienne plateforme. Elle travaillera à la fois dans l’équipe de Criblage Haut Débit (HTS) et de Séquençage Haut Débit (NGS).
Collaborations
ANR targetBD : Approche pharmacologique des troubles bipolaires résistants au lithium.
– INSERM, Centre de Recherche en Myologie, Sorbonne Université, UMRS974, INSERM, Institut de Myologie-Faculté de Médecine de la Pitié Salpêtrière, Antoine Muchir
– CNRS UMR 5310 – INSERM U1217, Institut NeuroMyoGène, Université de Lyon, Arnaud Jacquier, Laurent Shaeffer
– INSERM U955 IMRB UPEC, Créteil, Frederic Relaix
– INSERM U1251, Marseille Medical Genetics, Valérie Delague
Publications
Identification of signaling pathways modifying human dopaminergic neuron development using a pluripotent stem cell-based high-throughput screening automated system: purinergic pathways as a proof-of-principle.
01 janvier 2023
Frontiers in pharmacology
Contribution of Human Pluripotent Stem Cell-Based Models to Drug Discovery for Neurological Disorders.
24 novembre 2021
Cells
Rescuing compounds for Lesch-Nyhan disease identified using stem cell-based phenotypic screening.
27 février 2020
JCI insight
Bravo-Benchcel
Automate de pipetage moyen débit associé à une station de stockage de microplaque, utilisé pour la mise au point des premières étapes de l’Assay development.
Biocel 1800
Plateforme de criblage haut débit de l’institut permettant de réaliser le compound management et les criblages primaires (2006 AFM_Inserm_Genopole)
Plateforme de fixation et d’immuno-marquage
Utilisée pour réaliser à haut débit les marquages lors des criblages en High Content Screening (HCS) (2018 ou 2019)
Clariostar
Lecteur de microplaque HTS multimodes permettant la quantification de marqueurs en luminescence, fluorescence, TR-FRET, Alphascreen, Alphalisa, HTRF et Absorbance. (2013 genopole)
CX7 Cellomics et Image Express (Lecteurs HCS)
Microscope automatisé permettant de quantifier par fluorescence avec des objectifs allant du 5X jusqu’au 63X des biomarqueurs par immunofluorescence.
Quantstudio 12k et 7k
Appareils de PCR en temps réel permettant de quantifier l’expression de gènes cibles en format 96 ou 384 puits (plateforme NGS)