Bioproduction

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Bioproduction

La plateforme Bioproduction a pour missions d’optimiser les procédés et produire des banques de cellules. Elle est équipée de plusieurs automates et assure les contrôles analytiques des projets de recherche fondamentale, translationnelle ou à visée clinique. En parallèle, elle assure le développement de nouvelles technologies et méthodes afin de répondre aux évolutions scientifiques du domaine.

La plateforme de production automatisée existe depuis 2011 dans les locaux d’I-Stem. Elle est composée de plusieurs éléments : un Compact Select (Sartorius Stedim), permettant la culture de cellules en système adhérent (flacons de culture T75, T175 et triples), d’un système de répartition en tubes,  le Fill-It (Sartorius Stedim) et d’un automate de descente en température contrôlée, le Cryomed (ThermoFisher). Il permet d’assurer une viabilité maximale des cellules lors de leur stockage cryogénique.

Depuis son installation, une équipe est dédiée à son fonctionnement et l’activité est montée en puissance. Outre la production de cellules pluripotentes à grande échelle (400 tubes, 2 milliards de cellules), de nombreuses différenciations cellulaires utilisées au laboratoire ont été implémentées (MSC, Kératinocytes, RPE, Myoblastes etc). Le Compact Select est un système flexible, qui permet la production de plusieurs lots différents en parallèle.

Toutes les banques de cellules sont soumises à un contrôle qualité strict afin de s’assurer qu’elles remplissent les critères de libération de lots (statut sanitaire, stabilité génomique, phénotype etc).

Outre la production aux équipes, la plateforme est impliquée dans des projets académiques ou industriels. Ainsi, fin 2019, la plateforme s’est équipée de 2 systèmes de culture semi-automatisés, les CliniMACS Prodigy (Miltenyi Biotech), déjà utilisés pour la clinique. Ce sont des systèmes clos qui permettent de produire des cellules selon la réglementation des bonnes pratiques de fabrication (BPF). Ces systèmes permettent le développement de procédés d’amplification et de différenciation facilement transférables à une structure de production BPF dans le cadre de projets de thérapie cellulaire. Ces systèmes sont aujourd’hui validés pour la production à large échelle de cellules pluripotentes mais également pour la différenciation en différents types cellulaires.
Les missions de la plateforme Bioproduction sont désormais d’adapter les processus à l’automatisation, d’accompagner les équipes tant dans l’optimisation des protocoles et dans la mise en place de contrôles analytiques robustes selon les référentiels internationaux. Pour ce dernier point nous avons entièrement dédié une partie de la plateforme au développement analytique incluant une forte activité de cytométrie en flux.

Équipe

Olivier Chose

Resp. Plateforme (CECS)

Olivier, PhD, est diplômé de l’Université de Technologie de Compiègne. Il s’est spécialisé en bioproduction de protéines recombinantes et a rejoint I-Stem en 2009. Il est responsable de la plateforme depuis 2014.

Léa Lesueur

Ingénieure Bioproduction (CECS)

Titulaire d’un master en Biologie/Toxicologie, Léa a rejoint la plateforme en 2017. Elle est également en charge des développements de contrôles analytiques et de la gestion de la Biobanque d’I-Stem.

Adeline Beuriot

Ingénieure Bioproduction (CECS)

Titulaire d’un doctorat en Physiologie, Physiopathologie et Thérapeutique, Adeline a rejoint la plateforme en 2021. Elle participe actuellement au transfert et au développement de procédés de différenciation cellulaire en vue d’une automatisation sur le Prodigy, notamment dans le cadre du programme Genesis. Elle est également impliquée dans les différents programmes de recherche et de développement de l’équipe.

Margot Bouquier

Ingénieure Bioproduction (CECS)

Après un master en Oncologie et biothérapies, Margot s’est spécialisée dans les thérapies cellulaires. Elle a rejoint I-Stem en 2023 pour produire des banques de cellules au sein de la plateforme de Bioproduction.

Collaborations

GENESIS 

Consortium financé d’un PSPC. Il Réunit 5 partenaires : Adhara (groupe URGO), l’EFS-ABG (Nantes), Dassault Systèmes et le LBTI (CNRS / Université Claude Bernard Lyon1) et I-Stem.

Programmes Myopharm
(AFM-Téléthon) Production des ressources biologiques

– INSERM, Centre de Recherche en Myologie, Sorbonne Université, UMRS974, INSERM, Institut de Myologie-Faculté de Médecine de la Pitié Salpêtrière, Antoine Muchir
– CNRS UMR 5310 – INSERM U1217, Institut NeuroMyoGène, Université de Lyon, Arnaud Jacquier, Laurent Shaeffer
– INSERM U955 IMRB UPEC, Créteil, Frederic Relaix
– INSERM U1251, Marseille Medical Genetics, Valérie Delague

Publications

Optogenetically controlled human functional motor endplate for testing botulinum neurotoxins.

05 décembre 2021

de Lamotte Juliette Duchesne,

Polentes Jérôme,

Roussange Florine,

Lesueur Léa,

Feurgard Pauline,

Perrier Anselme,

Nicoleau Camille,

Martinat Cécile,

Stem cell research & therapy

The Future of Regenerative Medicine: Cell Therapy Using Pluripotent Stem Cells and Acellular Therapies Based on Extracellular Vesicles.

27 janvier 2021

Jarrige Margot,

Frank Elie,

Herardot Elise,

Martineau Sabrina,

Darle Annabelle,

Benabides Manon,

Domingues Sophie,

Chose Olivier,

Habeler Walter,

Lorant Judith,

Baldeschi Christine,

Martinat Cécile,

Monville Christelle,

Morizur Lise,

Ben M'Barek Karim,

Cells

Expression of miRNAs from the Imprinted Locus Signals the Osteogenic Potential of Human Pluripotent Stem Cells.

26 novembre 2019

Barrault Laetitia,

Gide Jacqueline,

Qing Tingting,

Lesueur Lea,

Tost Jorg,

Denis Jerome Alexandre,

Cailleret Michel,

Aubry Laetitia,

Peschanski Marc,

Martinat Cécile,

Baghdoyan Sandrine,

Cells

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Sartorius Stedim

Compact Select

Système robotisé de culture cellulaire (adhérentes) en flasques (T75, T175 tripleFlasks) utilisant un bras anthropomorphique et plusieurs outils (microscope, pipettes…).
Installé en 2011, financement INSERM, région IDF

Miltenyi Biotec

CliniMACS Prodigy

Système semi automatisé en système clos pour la culture cellulaire adhérente en grandes flasques (CellSTACK Corning). Conforme aux BPF. 2 systèmes sont installés depuis fin 2019.

Sartorius Stedim

Fill-It

Système automatisé de remplissage. Il permet l’ouverture, le remplissage et la fermeture simultanée d’une matrice de 96 cryotubes. Chaque tube a un code-barres unique sur le fond pour assurer la traçabilité.

Thermofisher

Cryomed

Système de descente contrôlée en température, fonctionne à l’azote et assure une certaine qualité de congélation. Installé en 2011, financement Genopole.

Thermofisher

Lecteur VisionMate

Scanner qui décode instantanément les codes-barres 2D des racks de 96 cryotubes pour en assurer la traçabilité.

Miltenyi Biotec

MACSQuant 10 & MACSQuant X

Cytomètres de flux possédant 3 lasers et permet la mesure jusqu’à 10 paramètres. Acquisition en 2021 du MACSQUANT X, financement Genopole.

Thermofisher

Countess II

Compteur automatisé de suspensions cellulaires.